El organismo, creado bajo decreto en 2002, sesionó con miras a un cambio profundo en el Sistema Nacional de Salud. El vicepresidente de la República, Alfredo Borrero y la ministra de Salud, Ximena Garzón, conforman su directorio.
Con el apoyo de la OPS, el Gobierno presentó el desarrollo del denominado “Plan Fénix” como apoyo en el plan de vacunación dentro de las zonas rurales del país. El plan contará con el despliegue operativo y la logística de las Fuerzas Armadas.